Le SYTEC est administré par un Comité Syndical composé de représentants des intercommunalités adhérentes.
Le comité syndical est l’assemblée délibérante chargée de gérer, par ses délibérations, les affaires du syndicat dans le cadre des compétences transférées par les établissements publics de coopération intercommunale membres. Il définit et arrête les orientations, les stratégies et les actions à mettre en oeuvre. Il vote les moyens financiers correspondants (budget général/budget annexe Environnement et budget SCOT Ingéniérie).
Le Comité Syndical est convoqué par le Président qui fixe l’ordre du jour.
Il est composé de délégués désignés par les EPCI membres, selon les conditions de représentation suivantes :
- Pour Saint-Flour Communauté : 20 délégués
- Pour Hautes Terres Communauté : 14 délégués
- Pour la Communauté de Communes du Pays Gentiane : 6 délégués.
Soit au total 40 délégués membres du Comité Syndical.